美国发觉三例“奥密克戎”基因变异菌株感柒病案，奥密克戎菌株和原始菌株

印度输入！中疾控周报披露首次检出“隐形”奥密克戎变异株细节

1月3日晚，《中国疾病预防控制中心周报（英文）》在线发文披露了我国首次检出“隐形”奥密克戎变异株的具体情况。

《周报》介绍，2021年12月19日，一名31岁的男性登上了从印度布巴内斯瓦尔飞往印度孟买的航班，然后又从孟买飞往阿曼马斯喀特。12月24日，他从马斯喀特乘飞机回到广州，被转移到佛山的一家集中隔离酒店。他在隔离的第三天接受了核酸采样，于2021年12月27日核酸结果呈阳性。当天，该病例被负压救护车送往广州市第八人民医院隔离治疗。根据胸部CT检查发现双肺局部性炎症。

2021年12月28日，广东省疾控中心对输入病例的鼻拭子标本进行测序。2021年12月29日，测序分析得出结论，该病毒基因组属于BA.2谱系，为奥密克戎变异株。与武汉参考序列比较，该病例菌株显示67个核苷酸变异位点。在进化分支上报道的序列最类似于2021年12月20日在新加坡和2021年12月1日在澳大利亚报道的序列。在蛋白质水平上，共观察到49个氨基酸突变位点和9个氨基酸缺失，其中棘突蛋白有27个突变和3个缺失。

2021年11月26日，奥密克戎变异株被世界卫生组织(WHO)列为第五种“需要关注的变异株”。研究表明，奥密克戎变异株进化为3个谱系，分别为BA.1、BA.2和BA.3，其中以BA.1谱系最为流行。BA.2谱系被非正式得称为“隐形的奥密克戎”，它不同于“标准”品种，缺少一种特殊的基因变异。全球共享流感数据倡议组织(GISAID)上传了89条BA.2序列，大部分序列来自南非、丹麦、加拿大、英国、美国、印度等国家。最早的BA.2序列于2021年11月27日在南非上传。

《周报》指出，该病例是在我国发现的首个BA.2谱系患者。由于BA.2谱系的基因组差异，其生物学特性和传播率可能有所不同，因此需要进一步研究和长期监测。